理事会
   理事长    蔡  威     农工党中央副主席，上海市人大常委会副主任
   理  事     李亚宁    上海交通大学农业与生物学院特别顾问 

   理  事     黄耀文    美国佐治亚大学食品科学系终身教授

   理  事     周  培     上海交通大学农业与生物学院党委书记

   理  事     薛红卫    上海交通大学农业与生物学院院长
   理  事     孙丽珍    上海交通大学科学技术发展研究院副院长

顾问委员会

   主    席    任筑山    前美国农业部副部长 

   副主 席    盛焕烨    原上海交通大学常务副校长

   委    员    贾敬敦    科学技术部火炬高技术产业开发中心主任

   委    员    邵  薇     中国食品科学技术学会秘书长

   委    员    吴永宁    国家食品安全风险评估中心技术总师   

   委    员    陈泽民    全国工商联农业产业商会荣誉会长

   委    员    黄耀文    美国佐治亚大学食品科学系终身教授

   委    员    蒋   纲     麦当劳全球食品和包装安全高级总监

   委    员    王   铁     上海开能环保设备股份有限公司总裁

中心领导班子
 
   主    任 ：   周  培     上海交通大学农业与生物学院党委书记
   副 主 任：  史贤明    上海交通大学农业与生物学院教授
   副 主 任：  李云飞    上海交通大学农业与生物学院教授 
   副 主 任：  张少辉    上海交通大学农业与生物学院研究员 
   副 主 任：  陆贻通    上海交通大学农业与生物学院教授  
   副 主 任：  张大兵    上海交通大学生命科学技术学院教授
   副 主 任：  岳  进      陆伯勋食品安全研究中心副主任
 
下设机构

中心办公室   检测实验室   食品安全与微生物    农业生境安全与控制     转基因食品安全检测
 
食品组分功能与研究     食品加工与包装    食品化学与营养